Investigador/a (Doctorat en Bioinformàtica, Biologia Computacional, Ciències de la Vida, Ciència de

Hace 3 días

Madrid, Madrid, España Hospital del Mar Research Institute Jornada completa
ligència Artificial i Dades en Salut Descripció

La persona seleccionada s'incorporarà al Intel ligència Artificial i Dades en Salut (Programa de recerca en informàtica biomèdica). Ref.

FIMIM3317-DOPAZO Institució

FUNDACIÓ IMIM Investigador/s Responsable/s Del Projecte

Joaquin Dopazo Blázquez Títol Del Projecte

Neoadjuvant-adjuvant immunotherapy to improve survival in hepatocellular carcinoma (RETOS245779LLOV) Grup / Servei

Intel Descripció

La persona seleccionada s'incorporarà al Intel ligència Artificial i Dades en Salut (Programa de recerca en informàtica biomèdica). Tasques Que Realitzarà

Dissenyar i mantenir pipelines reproduïbles per al control de qualitat, la normalització, l'anotació i l'harmonització de dades biomèdiques. Analitzar dades genòmiques, transcriptòmiques, de cèl lula única (single-cell), de transcriptòmica espacial i de microbioma tumoral. Integrar dades òmiques, clíniques i experimentals mitjançant mètodes estadístics, aprenentatge automàtic i intel ligència artificial. Desenvolupar i validar models predictius de resposta terapèutica, recurrència i supervivència lliure de malaltia en el carcinoma hepatocel lular. Aplicar tècniques d'intel ligència artificial explicable per identificar les variables i els mecanismes biològics associats a les prediccions. Participar en l'anàlisi computacional d'imatges histopatològiques i radiològiques, així com en la seva integració amb dades clíniques i moleculars. Identificar biomarcadors, vies moleculars i mecanismes de resposta o resistència a l'atezolizumab, el bevacizumab i la vacuna personalitzada. Contribuir a la priorització de dianes terapèutiques i a l'anàlisi computacional dels compostos identificats en els estudis preclínics. Garantir la traçabilitat, la interoperabilitat i la reutilització de les dades i dels resultats d'acord amb els principis FAIR i els requisits de protecció de dades. Col laborar amb els equips clínics i experimentals del consorci, i contribuir a l'elaboració d'informes, publicacions, presentacions i reunions de seguiment del projecte. Formació

Doctorat en Bioinformàtica, Biologia Computacional, Ciències de la Vida, Ciència de Dades, Matemàtiques, Informàtica o disciplines afins. Experiència

Experiència investigadora, preferentment postdoctoral, en anàlisi de dades òmiques i biomèdiques, disseny de pipelines reproductibles i aplicació de mètodes estadístics o d'aprenentatge automàtic. Es valorarà l'experiència en oncologia, immunoteràpia i anàlisi d'imatges biomèdiques. Coneixements

Dominis de R i/o Python i d'entorns Linux; coneixements d'integració multiómica, intel ligència artificial i principis FAIR; nivell avançat d'anglès; autonomia, rigor científic i capacitat per treballar amb equips multidisciplinaris. Contracte

Indefinit d’activitats cientifico-tècniques 12p