Titulado/a Superior para la Unidad de Microscopía Confocal

hace 3 semanas


Madrid, España CNIO A tiempo completo

Descripción

La Unidad de Microscopía Confocal, dentro del Programa de Biotecnología del CNIO, solicita candidatos/as para cubrir una plaza de Titulado/a Superior con perfil computacional orientado la investigación biomédica que tenga experiencia en:
• Análisis automático de imagen de microscopia de fluorescencia.
• Métodos de inteligencia artificial para segmentación de imagen.
• Herramientas de visualización y exploración datos multidimensionales.
De esta manera se quiere apoyar a la investigación científica del CNIO en este ámbito y garantizar el desarrollo de estas capacidades dentro de la Unidad.
Funciones y responsabilidades de la posición:
• Diseñar, implementar, combinar y mantener rutinas de tratamiento y análisis de imágenes automáticos utilizando diferentes programas de acceso libre y comerciales (Image J, QuPath, Cell Profile, Icy, Imaris, Ilastik, LASX, Harmony).
• Desarrollar nuevos scripts utilizando programas de lenguaje mayoritariamente libre (JAVA,Groovy, Python, Matlab) para implementar métodos de Deep Learning (Cell pose, Stardist, Napari) en las rutinas de análisis y mejorar la extracción de informa.
• Integrar deferentes rutinas de análisis utilizando Nextflow para que sean accesibles, reproducibles y transferibles a los investigadores y que además se pueda escalar el procesamiento utilizando clústeres o servidores computacionales.
• Desarrollar métodos de visualización de datos multidimensionales que permitan la exploración e interpretación de conjuntos de datos grandes de imágenes.
• Detección de aberraciones ópticas en la formación de imagen originadas por instrumentación de los equipos y el diseño de sus posibles soluciones incluyendo su aplicación simultánea durante la adquisición.
• Desarrollo de flujos de trabajo para mejorar la automatización de la adquisición de imágenes mediante la integración de scripts en los equipos para dirigir las capturas.
• Contribuir en el mantenimiento de los programas de análisis de la unidad, y responder a las necesidades computacionales y de almacenamiento, para facilitar el flujo de procesamiento y transferencia de datos y resultados.
• Mantener activos los repositorios de datos y códigos generados en la unidad en las plataformas de intercambio y almacenamiento de datos (GuitHub y Gitlab) para la accesibilidad y transferencia a los investigadores y comunidad científica.
• Proporcionar formación y transferir las rutinas de análisis a los investigadores usuarios y a los otros miembros de la Unidad.
• Generar material de apoyo y guías para fomentar el uso de métodos computacionales en la microscopía.
• Contribuir al diseño de proyectos científicos, incluyendo el seguimiento y la transferencia de metodologías de análisis de imágenes.

Criterios de evaluación

• Titulado superior (Grado, Licenciatura) en cualquier rama de las Ciencias de la Vida, Matemáticas, Física o Ciencia Computacional. Se valorará estudios superiores de Máster y doctorado en las ramas mencionadas.
• Experiencia previa en proyectos de investigación científica y publicación de artículos..
• Experiencia en trabajar en proyectos de Unidad de Microscopía.
• Experiencia en el desarrollo de nuevos scripts para el procesamiento y análisis de imagen en 2D, 3D y 4D utilizando lenguajes de programación de acceso libre.
• Experiencia en uso de herramientas y desarrollo de modelos de Deep Learning (IA) de acceso libre para el análisis de imagen de microscopía.
• Experiencia en integración de rutinas de análisis de imagen y manejo de librearías de procesamiento de imagen basados en diferentes lenguajes de programación.
• Experiencia en enseñar y trabajar en equipo respondiendo a necesidades de investigación.
• Experiencia en trabajar en institutos de investigación internacionales, así como asistencia a conferencias.
• Conocimiento extenso y demostrable del uso y de entorno (API) de Image J/FIJI.
• Conocimiento de sistema operativo Linux y su manejo de la terminal para interaccionar con servidores computacionales a través de SLURM.
• Conocimiento demostrable de programación y del manejo de librerías de procesamiento relacionadas con el análisis de imagen en 2D y 3D (Python, Java, Groovy, Matlab).
• Conocimiento profundo de herramientas de Deep Learning y capacidad de entrenamiento y generar modelos para la segmentación celular en imágenes de microscopia (Cell pose, Stardist, Napari, Tensorflow).
• Capacidad de integrar moldeos de Deep Learning en rutinas de análisis de imagen, utilizando la herramienta Nextflow.
• Conocimiento y manejo de plataformas de intercambio de datos y código como Github y Gitlab.
• Habilidades para la comunicación y el trabajo en equipo.
• Habilidad para trabajar dando servicio y manejar proyectos en paralelo de diferentes duraciones.
• Ingles fluido.

Se ofrece

– Incorporación a un Centro de Investigación de relevancia internacional.
– Remuneración competitiva.
– Beneficios sociales.



  • Madrid, España CNIO A tiempo completo

    Descripción La Unidad de Genotipado Humano-CEGEN, dentro del Programa de Genética del Cancer Humano , solicita candidatos/as para cubrir una plaza de titulado superior para desarrollar tareas administrativas en la Unidad.Criterios de evaluación– Titulado Superior. – Al menos 3 años de experiencia de trabajo demostrable en labores administrativas. –...


  • Madrid, España Cnio A tiempo completo

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  • Titulado/a Superior

    hace 1 mes


    Madrid, España Emprego ES A tiempo completo

    TITULADO/A SUPERIOR **Datos**: **Datos Adicionales**: El proceso de selección se llevará a cabo siguiendo lo establecido en el régimen jurídico de la convocatoria. La publicación de la oferta de empleo se hace a efectos informativos. No se permitirán **Datos de Contacto**: Oferta de empleo 13 2023 001402. No residentes en España: Adjuntar CV en...

  • Titulado/a Superior

    hace 1 mes


    Madrid, España Emprego ES A tiempo completo

    TITULADO/A SUPERIOR **Datos**: **Datos Adicionales**: El proceso de selección se llevará a cabo siguiendo lo establecido en el régimen jurídico de la convocatoria. La publicación de la oferta de empleo se hace a efectos informativos. No se permitirán **Datos de Contacto**: Oferta de empleo 13 2023 001478. No residentes en España: Adjuntar CV en...


  • Madrid, España Tragsa A tiempo completo

    Nº de puestos: - 1- Empresa: - Tragsa- Proyectos: - Empresa de Transformación Agraria, S.A., S.M.E., M.P., empresa matriz del GRUPO TRAGSA, especializada en trabajos relacionados con del desarrollo el medio rural y conversación de la naturaleza, precisa incorporar un Titulado/a Superior en Derecho para prestar apoyo en la revisión de expedientes de...

  • Titulado Superior

    hace 1 mes


    Madrid, España Empirical Advances A tiempo completo

    Función: Procesos de valorización sostenibles y de bajo coste de subproductos de la industria agroalimentaria para la preparación de bio-aditivos, estructuras carbonáceas y materiales polímeros bio-basados para aplicaciones en energía y transporte - Empresa: Empirical Advances - Nº de Plazas: 1 - Referencia: 2347 - Publicada el 20/3/2024 -...


  • Madrid, España Tragsa A tiempo completo

    Nº de puestos: - 1- Empresa: - Tragsa- Proyectos: - Empresa de Transformación Agraria S.A. S.M.E. M.P. (TRAGSA), empresa matriz del GRUPO TRAGSA, busca incorporar un/a titulado/a superior para trabajos de planificación de dehesas, la modernización y digitalización del colectivo de agentes del medio natural. - Funciones: - Ensayo y mantenimiento de...


  • Madrid, España Universidad Carlos III de Madrid A tiempo completo

    Función: Generación de modelos in vitro de piel y sistemas organ-on-chip - Empresa: Universidad Carlos III de Madrid - Nº de Plazas: 1 - Referencia: SKINONCHIP-POSTDOC - Publicada el 30/01/2023 - Publicada hasta el 30/03/2023 - Tipo de Contrato: Contrato temporal - Dedicación: Jornada completa - Remuneración Bruta (euros/año): 26400 - Localidad:...


  • Madrid, España Navantia A tiempo completo

    La empresa Navantia S.A., S.M.E. realiza la siguiente Convocatoria para sus oficinas centrales de Madrid: **1 vacante de Titulado/a Superior Especialista en consolidación contable** En el siguiente enlace: Bases del proceso de Selección: Titulado/a Superior Senior (Especialista) (navantia.es) encontrarás los requisitos de acceso, documentación a aportar...


  • Madrid, España S2022BMD-7274_RETAR-A-COVID-CM (CNB-CSIC) A tiempo completo

    Función: Estudios de la polarización de macrófagos, influencia del metabolismo y papel de las quimioquinas en enfermedades inflamatorias. - Empresa: S2022/BMD-7274_RETAR-A-COVID-CM (CNB-CSIC) - Nº de Plazas: 1 - Referencia: S2022/BMD-7274 - Publicada el 1/12/2023 - Publicada hasta el 10/12/2023 - Tipo de Contrato: Programas de Actividades de I+D de la...


  • Madrid, España Emprego ES A tiempo completo

    TITULADO SUPERIOR EN PUBLICIDAD CON DISCAPACIDAD **Datos**: **Datos Adicionales**: LICENCIATURA EN ADMINISTRACIÓN Y DIRECCIÓN DE EMPRESAS. Experiência de 3 años en Trade maketing empresa multinacional. Diseño, definición, ejecución y coordinación de la estrategia, de la categoría y acciones promocionales que alcancen los objetivos de negocio....


  • Madrid, España CNIO A tiempo completo

    Descripción El Grupo de Mecanismos Estructurales de la Regulación del Metabolismo y Crecimiento Celular, perteneciente al Programa de Biología Estructural del CNIO, solicita candidatos para cubrir un puesto de Investigador/a Científico/a para trabajar en la determinación de la estructura de complejos macromoleculares mediante crio-microscopía...


  • Madrid, España SENASA A tiempo completo

    **CONVOCATORIA DE PUESTO DE TRABAJO (8523)** SENASA, en el ámbito de la selección de personal, sigue el principio de igualdad de trato y de oportunidades entre mujeres y hombres en lo que se refiere al acceso al empleo y promoción, de acuerdo con lo establecido en el artículo 14 de la Constitución Española, y lo previsto en el art. 5 de la Ley...


  • Madrid, España Navantia A tiempo completo

    La empresa Navantia S.A., S.M.E. realiza la siguiente Convocatoria para sus oficinas centrales de Madrid: **1 vacante de Titulado/a Superior Junior de Operaciones Financieras** En el siguiente enlace: Bases del proceso de Selección: Técnico/a Superior Junior (navantia.es) encontrarás los requisitos de acceso, documentación a aportar (obligatoria) y otra...


  • Madrid, España Universidad Nebrija A tiempo completo

    Función: Habilidades biológicas in vivo aplicadas a nuevas terapias no invasivas para la mejora de la enfermedad de Alzheimer. Se realizan trabajos preclínicos in vivo, biología molecular y estudios en humanos (nuevos biomarcadores, comportamiento y microscopía). - Empresa: Universidad Nebrija - Referencia: PHOTONEU CPP2022-009646 - Publicada el...


  • Madrid, España Navantia A tiempo completo

    La empresa Navantia S.A., S.M.E. realiza la siguiente Convocatoria para sus Oficinas Centrales en Madrid: **1 vacante de Titulado/a Superior Junior en Asesoría Jurídica.** *** En el siguiente enlace: Bases del proceso de Selección: Técnico/a Superior Junior (navantia.es) encontrarás los requisitos de acceso, documentación a aportar (obligatoria) y...


  • Madrid, España Navantia A tiempo completo

    La empresa Navantia S.A., S.M.E. realiza la siguiente Convocatoria para sus oficinas centrales de Madrid: - ** 1 vacante de Titulado/a superior junior en Gestión del Cambio RRHH** En el siguiente enlace: Bases del proceso de Selección: Técnico/a Superior Junior (navantia.es) encontrarás los requisitos de acceso, documentación a aportar (obligatoria) y...


  • Madrid, España Universidad Nacional de Educación a Distancia (UNED) A tiempo completo

    Función: La persona contratada se incorporará al grupo de Procesamiento del Lenguaje Natural (PLN) de la UNED, uno de los más prestigiosos a nível internacional para desarrollar herramientas de Machine Learning, Deep Learning, Inteligencia Artificial y PLN. - Empresa: Universidad Nacional de Educación a Distancia (UNED) - Nº de Plazas: 1 - Referencia:...


  • Madrid, España Grupo Tragsa A tiempo completo

    Titulados/as Superiores o Medios/as para Gestión Ayudas FEAGA (Madrid) **Vacantes Previstas**: 9 **Empresa**: Tragsatec **Proyecto/ Motivo contratación**: Empresa de Tecnologías y Servicios Agrarios, S.A., S.M.E., M.P., empresa filial del GRUPO TRAGSA, especializada en la realización de actividades de ingeniería, consultoría y asistencia técnica en...


  • Madrid, España SENASA A tiempo completo

    **CONVOCATORIA DE PUESTO DE TRABAJO (5123)** SENASA, en el ámbito de la selección de personal, sigue el principio de igualdad de trato y de oportunidades entre mujeres y hombres en lo que se refiere al acceso al empleo y promoción, de acuerdo con lo establecido en el artículo 14 de la Constitución Española, y lo previsto en el art. 5 de la Ley...